Macrofagen zijn sterk gedifferentieerde immuuncellen in verschillende weefsels van het lichaam, waar ze de rol spelen van "aaseters van het menselijk lichaam". Macrofagen concentreren zich waar er behoefte is aan het elimineren van afval, zoals een pak slaag, een weefselafbraakproduct of een beschadigde cel.
Tijdens zijn bestaan kan een macrofaag meer dan 100 bacteriën elimineren, maar indien nodig kan het ook grotere deeltjes uit de weefsels verwijderen, zoals oude rode bloedcellen of necrotische neutrofielen (neutrofielen zijn een ander type witte bloedcellen met faagactiviteit)., dus vergelijkbaar met die van macrofagen, maar ze zijn kleiner en veel talrijker, en ze werken vooral op een bloedniveau). In het algemeen absorberen en verteren macrofagen antigenen, of wat vreemd is aan het organisme of wordt als zodanig herkend, daarom waardig voor aanval en neutralisatie. Zodra de antigenen zijn verteerd, verwerken de macrofagen enkele componenten waardoor ze op hun buitenmembraan worden blootgesteld, gekoppeld aan oppervlakte-receptoren (MHC-eiwitten, genaamd "major histocompatibility complex"). Deze complexen, die erg belangrijk zijn voor de immuunfunctie, fungeren als speciale "antennes" of "identificerende vlaggen" die het gevaar aangeven voor andere immuuncellen, waarvoor versterkingen nodig zijn. Wanneer ze deze functie afdekken, worden macrofagen antigeenpresenterende cellen genoemd ( Antigen-Presenting Cell ).
Naast het presenteren van antigeen aan lymfocyten, produceren en scheiden macrofagen een breed scala van uitscheidingsproducten (zoals enkele interleukinen of TNF-alfa tumornecrosefactor), die communicatie mogelijk maken tussen de verschillende soorten lymfocyten; ze kunnen daarom de migratie en activering van andere cellen van het immuunsysteem beïnvloeden.
Nadat het pathogeen is getransformeerd in voedsel van macrofagen, binden deze cellen het, omringen het en nemen het op en beperken het tot vesikels, fagosomen genaamd. In de macrofaag smelten fagosomen samen met lysosomen, vesicles rijk aan spijsverteringsenzymen en oxidatiemiddelen, zoals zure hydrolasen en waterstofperoxide, die doden en slopen wat is opgenomen. Zo worden fagolysosomen gevormd, ook wel bekend als 'kamers des doods'.
Naast grote lysosomen zijn macrofagen aanzienlijk groter dan de andere leukocyten, het Golgi-apparaat en de bijzonder ontwikkelde kern, en de rijkdom aan acto-myosine filamenten, die de macrofaag een zekere motiliteit geven (migratie op infectieplaatsen).