De door de bevoegde eenheden vastgestelde gezondheidscontrole voor aviaire influenza is niet alleen gekoppeld aan de economische gevolgen van de sterfgevallen onder dieren, maar ook aan de volksgezondheid . Wat de meeste zorgen experts is, is dat nieuwe virale subtypen in staat zijn ziekte te veroorzaken bij mensen en vooral van persoon op persoon overgedragen kunnen worden. Influenzavirussen van type A ondergaan in feite frequenties van genetische herhaling met hoge frequentie; dit maakt een opmerkelijk aanpassingsvermogen aan nieuwe gasten mogelijk en bepaalt de voortdurende verschijning van nieuwe virale stammen . Deze mutaties kunnen bijvoorbeeld optreden wanneer een humaan virus en een aviavirus hun genetisch erfgoed "uitwisselen" of wanneer het virus van de ene diersoort naar de andere gaat (de doorgang van vogels naar varkens is bijzonder gevaarlijk). Er is daarom de mogelijkheid dat uit een dierentank een nieuw virus kan ontstaan waarvoor de mens vatbaar is (zoals in de vorige eeuw gebeurde, bijvoorbeeld met de Spanjaarden van het virus A-H1N1 van 1919 of de Aziaat van A-H2N2 van 1957).
De uiteindelijke overdracht tussen mensen zou de ziekte in staat stellen zich wereldwijd te verspreiden, waardoor een vogelgrieppandemie ontstaat . Momenteel blijven de virussen met het hoogste pandemiepotentieel H5N1 en H7N9, omdat ze blijven circuleren onder kippen en ernstige ziekten bij mensen kunnen veroorzaken. Andere subtypes van virussen kunnen een pandemie veroorzaken, maar het risico wordt als lager beschouwd.
