Bij gebruik komen contactlenzen in contact met verschillende stoffen waaruit de traanfilm bestaat, waaronder eiwitten (lysozym, albuminen, mucopolysulfiden, fibronectine, enz.). Na verloop van tijd hechten deze zich aan het oppervlak van de lens en kunnen ze denatureren, waardoor de luchtvochtigheid en hydrofiliciteit afnemen. Dit maakt deze apparaten minder comfortabel dan ze zouden moeten zijn, en veroorzaakt ook atopische reacties, zoals papillaire conjunctivitis en roodheid van het oog . Bovendien creëren de aan de lenzen gehechte eiwitten kleine vlekken die het zicht vertroebelen .
Om eiwitafzettingen uit de lenzen te verwijderen, is het daarom essentieel om schoon te maken met detergentia en proteolytische enzymproducten, die regelmatig moeten worden uitgevoerd. Deze oplossingen zijn in staat om de bindingen te verbreken tussen eiwitmoleculen (nog niet gedenatureerd) die zo van de lens kunnen worden afgespoeld.
Een alternatief is om wegwerpbare contactlenzen te gebruiken : deze worden in feite veranderd en weggegooid zodra ze worden gebruikt, voordat een consistente ophoping van eiwitmateriaal kan worden gevormd.
