Bij dieren varieert de symptomatologie van aviaire influenza zowel in verhouding tot de virale stam die bij de infectie betrokken is als tot de aangetaste soort. Vooral bij vogels is de infectie goedaardig, als deze wordt veroorzaakt door laagpathogene virussen die tot alle H-subtypen behoren ( LPAI - Laagpathogene aviaire invloed ). De ziekte veroorzaakt door het LPAI-virus is gelokaliseerd en wordt gekenmerkt door respiratoire en enterische symptomen, vaak geassocieerd met algemene malaise, tranende en reproductieve abnormaliteiten bij landbouwhuisdieren (bijv. Verandering van ei en verminderde leg van eieren).
Daarentegen kunnen sommige virale stammen die behoren tot de subtypen H5 en H7 hoogpathogene aviaire influenza ( HPAI - High Pathogenic Avian Influence ) veroorzaken, een altijd systemische en ernstige ziekte, geassocieerd met hoge mortaliteit tussen sommige soorten wilde en gedomesticeerde vogels. De duidelijkste symptomen zijn in het zenuwstelsel, met depressie van de sensorische, achterwaartse rotatie van het hoofd en verlamming van de vleugels.
